Trening funkcjonalny opiera się na poprawie jakości wzorców ruchowych, które są wykorzystywane przez ćwiczącego podczas jego codziennej aktywności. Rodzaj ćwiczeń jest zależny od aktualnego poziomu wytrenowania oraz obranego celu treningowego. Może być nim np.:
- poprawa wykonywania podstawowych czynności dnia codziennego (u pacjentów we wczesnej fazie rehabilitacji po operacji kolana czy biodra),
- trening mobilności i stabilności, które stanowią podstawę dla kształtowania pozostałych cech motorycznych,
- trening siły, szybkości, wytrzymałości i mocy w odpowiednio dobranych wzorcach ruchowych,
- praca nad techniką wzorców typowych dla konkretnej dyscypliny sportowej w warunkach jak najbardziej zbliżonych do warunków naturalnych.