Leczenie chondromalacji polega głównie na ograniczeniu czynników przyspieszających zużycie chrząstki stawowej. Leczenie obejmuje normalizację masy ciała, unikanie nadmiernego przeciążania stawu, ćwiczenia wzmacniające mięśnie stabilizujące staw kolanowy, zabiegi z zakresu fizykoterapii oraz terapie biologiczne. Przy zaawansowanych zmianach konieczne jest leczenie operacyjne najczęściej przeprowadzane z wykorzystaniem artroskopu. W trakcie artroskopii lekarz ocenia wnętrze stawu i w zależności od zastanego stopnia i rozległości uszkodzeń chrząstki podejmuje czynności naprawcze. Przy niedużym uszkodzeniu chrząstki najczęściej oczyszcza się i wyrównuje powierzchnię stawową chrząstki przy pomocy shavera. W trakcie artroskopii wykonywane są zabiegi: mikrozłamania oraz techniki rekonstrukcyjne chrząstki rzepki z użyciem membrany Hyalofast lub membrany kolagenowe.